Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2aQ01320 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms