Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EgfrQ01279 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms