Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms