Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms