Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms