Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms