Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms