Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms