Protein–RNA interactions for Protein: Q00519

Xdh, Xanthine dehydrogenase/oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XdhQ00519 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XdhQ00519 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XdhQ00519 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XdhQ00519 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XdhQ00519 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XdhQ00519 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XdhQ00519 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XdhQ00519 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XdhQ00519 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XdhQ00519 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
XdhQ00519 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XdhQ00519 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
XdhQ00519 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
XdhQ00519 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
XdhQ00519 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
XdhQ00519 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
XdhQ00519 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
XdhQ00519 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
XdhQ00519 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XdhQ00519 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms