Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms