Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms