Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama4P97927 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lama4P97927 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lama4P97927 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lama4P97927 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lama4P97927 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lama4P97927 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama4P97927 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lama4P97927 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lama4P97927 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lama4P97927 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lama4P97927 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lama4P97927 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lama4P97927 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lama4P97927 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama4P97927 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lama4P97927 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama4P97927 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms