Protein–RNA interactions for Protein: P97857

Adamts1, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 1, mousemouse

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts1P97857 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Adamts1P97857 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts1P97857 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms