Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IhhP97812 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IhhP97812 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IhhP97812 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IhhP97812 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IhhP97812 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IhhP97812 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IhhP97812 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IhhP97812 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IhhP97812 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IhhP97812 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IhhP97812 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IhhP97812 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IhhP97812 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IhhP97812 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IhhP97812 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IhhP97812 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms