Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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