Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bop1P97452 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bop1P97452 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms