Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps45P97390 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps45P97390 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps45P97390 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps45P97390 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms