Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec1P97353 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec1P97353 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec1P97353 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms