Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-3P97334 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms