Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgcdP82347 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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