Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms