Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms