Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms