Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1P70338 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms