Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54lP70270 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54lP70270 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms