Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chl1P70232 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms