Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms