Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbdsP70122 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms