Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms