Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpnP63163 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpnP63163 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpnP63163 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpnP63163 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpnP63163 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpnP63163 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpnP63163 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpnP63163 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpnP63163 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpnP63163 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms