Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtnP63089 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtnP63089 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtnP63089 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtnP63089 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtnP63089 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtnP63089 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtnP63089 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtnP63089 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtnP63089 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtnP63089 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms