Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbdP63072 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbdP63072 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbdP63072 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbdP63072 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms