Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba52P62984 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba52P62984 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms