Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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