Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms