Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta2P62737 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms