Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms