Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms