Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps18P62270 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms