Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms