Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b6P59708 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms