Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr3bP59470 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr3bP59470 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms