Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhbdl3P58873 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rhbdl3P58873 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms