Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Paxbp1P58501 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Paxbp1P58501 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms