Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpdl3bP58242 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpdl3bP58242 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpdl3bP58242 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpdl3bP58242 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpdl3bP58242 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpdl3bP58242 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpdl3bP58242 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpdl3bP58242 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smpdl3bP58242 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms