Protein–RNA interactions for Protein: P57759

Erp29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp29P57759 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Erp29P57759 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erp29P57759 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms