Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms