Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn18P56857 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn18P56857 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn18P56857 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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