Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bace1P56818 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Bace1P56818 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms