Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms